Suppression du certificat et exécution ultérieure de la mise à jour des certificats CA laisse des liens symboliques persistants

J'ai supprimé un certificat (root) et j'ai exécuté à nouveau update-ca-certificates:

$ sudo rm /usr/local/share/ca-certificates/mine.root-ca.crt
ls -l /usr/local/share/ca-certificates/
total 4
-rw-r--r-- 1 root root 1838 Feb 16  2017 something-else.crt
$ sudo update-ca-certificates
Mise à jour des certificats dans /etc/ssl/certs...
0 ajouté, 0 supprimé; fait.
Exécution des hooks dans /etc/ca-certificates/update.d...
fait.

Mais :

$ ls -l /etc/ssl/certs/mine.root-ca.pem
lrwxrwxrwx 1 root root 53 Jun  4 07:22 /etc/ssl/certs/mine.root-ca.pem -> /usr/local/share/ca-certificates/mine.root-ca.crt

Mais ce fichier (/usr/local/share/ca-certificates/mine.root-ca.crt) n'existe plus.

En réalité, le 0 ajouté, 0 supprimé; fait. est suspect : il devrait dire 1 supprimé.

La validation du certificat ne fonctionne plus pour le domaine en question (comme prévu), mais ces deux faits m'ennuient:

• le lien qui persiste
• le fait que update-ca-certificates ne semble pas faire quoi que ce soit

Je suis sous :

$ lsb_release -a
No LSB modules are available.
Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 16.04.4 LTS
Release:        16.04
Codename:       xenial