Je suis très novice dans l'utilisation d'Ubuntu et je vous prie d'être indulgent avec moi si je présente une version très profane de l'explication.
Mon OS : Ubuntu 11.10 server, version 64bit
Je dois utiliser trois outils samtools , bowtie y tophat . Cependant tophat dépend de samtools et de bowtie. Le facteur de dépendance est - de déterminer où se trouve exactement le chemin vers les deux outils ci-dessus (samtools et bowtie).
Maintenant, je peux installer samtools et bowtie en utilisant sudo apt-get install cependant
- Je ne sais pas exactement où se trouvent les chemins des bibliothèques pour samtools ou bowtie.
- Selon les notes d'installation de tophat, je dois extraire l'outil du fichier compressé, changer le répertoire dans ce fichier et ./configure ; MAIS je ne vois pas le ./configure script dans le répertoire extrait.
Samtools y Noeud papillon y Tophat se trouvent sur leurs sites, c'est le méthode d'installation J'essaie de suivre.
