La plupart des terminaux semblent utiliser le copier sur la sélection et le bouton du milieu pour coller la sélection, ou le bouton du milieu émulé pour coller (en utilisant les deux boutons de la souris en même temps). Il s'agit d'un comportement typique d'Unix, et l'émulation est l'utilisation actualisée requise par les souris de type Microsoft avec seulement deux boutons ou deux boutons et une molette de défilement.
Les boutons de la souris pourraient être remappés avec xinput ou d'autres moyens. Cela diffère d'une version à l'autre et sur les différents modèles de souris. Voir le Documentation de la communauté Ubuntu pour ça.
Voir aussi cette question ce qui est l'inverse de la procédure dont vous auriez besoin.
Les terminaux que je possède qui utilisent la sélection pour copier et le milieu pour coller incluent le terminal Gnome, le terminal xfce, Eterm, le xterm ordinaire, uxterm, rxvt, mrxvt et aterm. Je suis sûr qu'il y en a d'autres.
Mon terminal principal, terminator (utilisez apt-get ou le centre des logiciels pour l'installer), vous permet de choisir la copie sur sélection comme option (avec un seul clic) :
Ouvrez les préférences et cliquez sur la case "copier sur sélection" :