NFS est très performant dans un réseau fermé et sa configuration est plus simple que celle de SMB. Le partage SMB est plus configuré en termes d'accès et de permissions et il est accessible par le système d'exploitation Windows.
Si vous avez besoin d'un partage simple qui ne peut être accédé que par des machines connues, je recommanderais NFS, surtout dans un réseau LAN, qui a de très bonnes performances. SMB est plus sûr mais nécessite plus de configuration (rien d'impossible) et il est accessible par presque tous les systèmes d'exploitation, c'est un must si vous avez besoin d'y accéder via un réseau WAN.
Dans votre cas, je suggère NFS, mais si vous avez l'intention d'étendre ses fonctionnalités à l'avenir, optez pour SMB.