L'outil Microsoft/Sysinternals Handle.exe peut déverrouiller des fichiers :
handle.exe -c 0x38 -p 1234
Vous voudrez probablement automatiser l'exécution préalable de la commande suivante pour trouver toutes les utilisations de app.exe
handle.exe \Chemin\vers\app.exe
Il faudrait ensuite interpréter les résultats pour obtenir l'identifiant de la poignée et l'identifiant du processus à passer à la première commande.
Toutefois, soyez averti que fermer les poignées derrière le dos de l'application risque probablement de rendre l'application instable.