Je pense qu'il y a deux choses ici. Premièrement : Ubuntu est et restera libre. Du moins, c'est ce que ils prétendent . Cela devrait répondre à certaines de vos préoccupations.
Ensuite, il y a Canonical. Cette société est une entreprise à but lucratif, censée gagner de l'argent en contribuant/supportant Ubuntu. Puisque Ubuntu est gratuit, ils doivent évidemment trouver d'autres moyens de gagner de l'argent. Et c'est là que le bât blesse : pour gagner de l'argent, ils prévoient d'ajouter de nouveaux services/fonctionnalités qui ne feront pas partie d'Ubuntu, mais seront vendus en parallèle. Ubuntu One en est un exemple.
Ce qui est débattu ici, c'est la façon dont ils y parviennent : en forçant chaque contributeur à renoncer à sa liberté dans le modèle de licence, et en laissant Canonical "posséder" tout ce qui a été contribué. Cet abandon de la liberté pose un problème éthique. Il va à l'encontre de l'"esprit" des licences de logiciels libres. Et pourrait briser l'esprit libre d'Ubuntu lui-même.
Je pense que le problème principal est une question à laquelle nous ne pouvons pas répondre maintenant : quelle part d'Ubuntu restera "gratuite" comme il est dit, et quelle part sera constituée de services optionnels vendus par Canonical ? Si de plus en plus de "super-fonctionnalités" sont ajoutées en tant qu'options payantes, on pourrait dire qu'Ubuntu est moins libre qu'il ne le devrait... Surtout si ces fonctionnalités sont des logiciels propriétaires (qui n'ont même pas le côté "libre comme la pêche" du sens de "libre").
Pour l'instant, je pense que Canonical fait toujours son travail, et je l'apprécie toujours. Ubuntu est une distribution vraiment solide et orientée utilisateur, et je ne changerai pas à cause de cet article. Mais c'est une déclaration personnelle, et comme je ne suis pas un défenseur du logiciel libre, elle ne peut pas être considérée comme "la" réponse à la question.
De plus, je n'ai pas vraiment de boule de cristal pour voir l'avenir :-) Dans quelques années, je changerai peut-être d'avis et commencerai à utiliser autre chose parce que Canonical a poussé trop loin son engagement pour la rentabilité... J'espère vraiment que ce ne sera pas le cas.