J'ai eu la même erreur... solution trouvée à l'adresse suivante
https://www.reddit.com/r/Ubuntu/comments/d95jh3/unable_to_update_gnome_application_platform/
C'est un runtime Flatpak, c'est-à-dire une collection de bibliothèques et d'outils utilisés par les applications qui ont été installées via Flatpak. Une des propriétés importantes de Flatpak est que vous pouvez installer et utiliser des applications qui ont besoin de bibliothèques provenant par exemple de Gnome 3.34, alors que votre système utilise une version beaucoup plus ancienne de Gnome (ou un DE entièrement différent). Donc, dans ce cas, vous mettez à jour ce runtime, et non la version de Gnome qui fonctionne comme votre DE.
Concernant l'erreur : Puisque le problème est que le runtime org.freedesktop.Platform/x86_64/19.08 n'est pas installé, essayez de l'installer manuellement.
flatpak install flathub org.freedesktop.Platform/x86_64/19.08
et ensuite réessayer la mise à jour
flatpak update