Ces conversions varieront selon le type de fichier. Une image stockera les métadonnées différemment qu'un document, qui stockera les métadonnées différemment qu'une vidéo. Même différents types de fichiers de choses similaires (par exemple, BMP et JPG) stockent leurs métadonnées différemment.
En tant que tel, vous aurez besoin d'applications uniques pour chacun de ceux-ci.
Pour les images, vous devriez pouvoir utiliser IrfanView, ce qui sera pratique car il peut traiter par lots des grands nombres de fichiers facilement.
Pour les documents, MS Office a certaines capacités ou processus, tels que définis par MS, pour minimiser les métadonnées incluses dans les documents. Malheureusement, la documentation MS traite principalement des anciennes versions.
Pour les versions 2003, il existe un outil MS pour supprimer les métadonnées: http://support.microsoft.com/default.aspx?kbid=834427
Pour les versions antérieures à 2003, MS a des documents sur la façon de supprimer ces informations: http://office.microsoft.com/en-us/excel-help/find-and-remove-metadata-hidden-information-in-your-legal-documents-HA001077646.aspx
Pour les nouvelles versions de office, le Payne Consulting Group a un nettoyeur (j'ai travaillé dans un grand cabinet d'avocats qui l'utilisait pour Office 2010) mais j'imagine que c'est horriblement cher. Il y a aussi iScrub et un autre nettoyeur documenté dans un article de Tech Republic: http://www.techrepublic.com/article/keep-microsoft-office-documents-clean-with-iscrub/5035132
J'ai trouvé un article MS sur l'inspection et le nettoyage des documents sans utiliser d'autres outils. C'est manuel, mais il est déjà inclus dans les produits MS, et la solution fonctionne dans la version 2010: http://office.microsoft.com/en-us/word-help/remove-hidden-data-and-personal-information-by-inspecting-documents-HA010354329.aspx