J'ai rencontré le même problème et j'ai trouvé une solution qui fonctionne. Je dispose maintenant d'une partition Windows chiffrée, d'une partition de données chiffrée et d'une partition Mac, exécutant Windows 7 et Mac OS X. Voir ma solution ici.
EDIT :
J'ai réalisé, après avoir lu des commentaires négatifs, que poster un lien était nul, surtout parce que mon ancien article avait disparu. Il se trouvait dans un ancien blog que je n'ai plus, mais j'ai réussi à récupérer le texte de l'article à partir d'une ancienne sauvegarde du stockage XML du blog. Voici l'article dans son intégralité. N'oubliez pas qu'il date de 2010 et que vous le faites à vos propres risques :
Ce document décrit les étapes nécessaires pour obtenir un système de double démarrage avec Windows 7 et Mac OS X, dans lequel la partition Windows est chiffrée avec Truecrypt. Ceci n'est pas possible avec Bootcamp.
Conseil : si vous êtes nouveau sur Mac et que vous ne parvenez pas à comprendre pourquoi la machine ne démarre pas à partir du DVD d'installation de Mac OS ou de Windows bien que vous ayez inséré le disque, vous pouvez maintenir enfoncée la touche d'option pendant le démarrage (celle avec le texte alt). Vous verrez alors apparaître un menu dans lequel vous pourrez sélectionner le système d'exploitation à démarrer et, si vous attendez un peu, le DVD d'installation apparaîtra également dans ce menu. C'est également ce que vous utilisez lorsque vous sélectionnez la partition à partir de laquelle vous souhaitez démarrer plus tard.
AVERTISSEMENT : Les étapes suivantes effaceront toutes les données de votre disque. Ok, c'est parti :
Démarrez et insérez le disque d'installation de Mac OS et laissez-le s'exécuter jusqu'à ce que vous puissiez utiliser l'Utilitaire de disque pour créer des partitions. Entrez dans l'onglet Partition de l'Utilitaire de disque.
Créez deux partitions : La première sur le disque est pour Windows et la seconde est pour Mac OS. Formatez la première en FAT32 et la seconde en Mac OS Extented (journalisé). Nous reformaterons la FAT32 en NTFS pendant l'installation de Windows. Windows doit être installé en premier sur le disque pour que TrueCrypt puisse le crypter comme un disque système.
Dans Options, sélectionnez GUID Partition Table. C'est très important . Appliquez les modifications et vérifiez que les informations en bas de l'utilitaire de disque indiquent qu'il s'agit de la table de partition GUID. Lorsque vous avez terminé, fermez l'Utilitaire de disque.
Installez Mac OS sur la partition que vous avez créée pour lui. Laissez le programme d'installation se terminer.
Démarrez la machine à partir du DVD Windows, supprimez la première partition GPT de protection de 200 Mo (Mac OS démarrera sans elle), supprimez la partition Windows et créez une nouvelle partition NTFS qui remplit le début du disque et terminez l'installation de Windows.
Démarrez sous Windows et cryptez la partition système de Windows. NE CHIFFREZ PAS LA PARTITION MAC. Cela signifie également que vous ne pouvez PAS crypter le disque entier. Truecrypt vous posera toutes sortes de questions.
Sous Windows, insérez le disque d'installation de Mac OS X et installez les pilotes bootcamp.
Désormais, lors du démarrage, il faut maintenir la touche Option enfoncée pour choisir entre Windows et Mac OS. Sous Mac, vous pouvez définir la partition à démarrer par défaut. Ce paramètre peut également être défini dans le panneau de configuration de Bootcamp sous Windows.
Vous avez terminé !
Note : Pendant la création des partitions, j'ai également créé une partition de données FAT32 entre la partition Windows et la partition Mac OS. J'ai reformaté et crypté cette partition de données avec Truecrypt et Windows et Mac y ont tous deux accès. Joli !