Oui, c'est vrai - sous réserve des restrictions d'accès habituelles au système de fichiers, bien sûr.
Quant à savoir pourquoi cela n'est pas considéré comme un problème :
Cela dépend de la modèle de menace - c'est-à-dire, sur les attaques et les attaquants dont vous vous inquiétez. En général, le cryptage des systèmes de fichiers n'est utile que comme protection contre les attaques physiques contre le matériel (par exemple, son vol).
Si un attaquant dispose d'un accès au réseau alors que le système est en cours d'exécution, ou même d'un compte sur le système, le cryptage du système de fichiers ne sera d'aucune utilité. Cependant, dans ce cas, les autorisations habituelles du système de fichiers sont utiles - ce qui montre bien que différentes mesures de sécurité se complètent.
C'est bien connu. Par exemple, le "Encrypted Filesystem Howto" d'Ubuntu avertit :
Panacées et boîtes noires
N'oubliez pas qu'il ne s'agit PAS d'un système parfait. Il est toujours vulnérable à vulnérable à des attaques de différentes manières, la plus évidente étant une attaque en en ligne. Si vous êtes en mesure d'accéder à vos données cryptées, alors toute autre personne qui s'introduit dans le système le fera aussi. [...]