Comment puis-je "aplatir" un nuage de points PDF avec de nombreux points générés avec R ?

C'est l'exemple parfait d'un excellent problème à résoudre, mais de la mauvaise question à poser. Vous travaillez déjà avec les données d'entrée dans R, alors pourquoi ne pas les traiter là ? Le PDF est essentiellement binaire, donc vous n'avez aucune chance de faire quoi que ce soit avec lui en l'état.

Votre meilleure chance est de prétraiter les données dans R avant de créer le PDF (c'est pour cela que R a été créé, après tout). La meilleure façon de résoudre ce problème serait de faire une boucle dans vos données d'entrée, et de supprimer tous les autres points partageant les mêmes coordonnées dans un certain seuil. Je l'intégrerais dans une fonction, afin que vous puissiez expérimenter avec différents seuils - mais je suis sûr que vous comprenez l'idée.

Ne compliquez pas trop les choses en introduisant des niveaux d'abstraction inutiles et des formats de fichiers supplémentaires. Vous avez déjà les données , travailler avec les données .

Je pense que les questions suivantes de Stack Overflow peuvent vous aider :

comment supprimer les doublons partiels d'un cadre de données ?

Identifier les données dupliquées avec un seuil

Enfin, vous pouvez envisager d'utiliser une carte thermique, le cas échéant, car elle permet d'afficher les mêmes informations (la couleur représentant la densité des points dans certaines zones) sans avoir à rendre chaque point de données individuellement.