J'ai fait quelques tests et l'intégration fonctionne généralement avec des éditeurs markdown en ligne tels que dillinger.io, jbt.github.io, stackedit.io Ce sujet n'est donc pas aussi noir et blanc que l'a écrit @Spiff ci-dessus.
Voici une capture d'écran de deux blocs base64 insérés en utilisant 1) une référence interne et 2) une insertion d'image courante (voir le code ci-dessous).
1) Le bloc base64 référencé cesse d'être analysé juste au moment où "un nouveau morceau d'image" commence, la partie verte. ... So4Z4wxkXa7KukmKul2dDvd ...
2) en passant directement le bloc on obtient l'image entière
code
1\)![png tester1][pngtester1] 2\)![png tester2](data:image/png;base64,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)
_1\) the referenced base64 block stops being parsed right at the point where 'a new chunk of image' starts, the green part `... So4Z4wxkXa7KukmKul2dDvd ...`
2\) by passing the block directly we get the whole image_
This was tested with http://tmpvar.com/markdown.html. I don't know how it behaves on github. [The issue](https://github.com/github/markup/issues/270) has been already well discussed.
[pngtester1]:data:image/png;base64,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
Ceci a été testé avec http://tmpvar.com/markdown.html . Je ne sais pas comment il se comporte sur github. La question a déjà été bien discuté.