Comment mettre en place un dépôt Git sécurisé ?

Vous semblez supposer que c'est git-daemon qui est responsable. Avez-vous confirmé que git-daemon est bien en cours d'exécution sur le système ? Vérifiez la liste des processus ainsi que la liste des ports ouverts :

$ ps auxwww | grep git-daemon
$ sudo netstat -ptuna | grep 9814

Si git-daemon ne fonctionne pas et qu'il n'y a rien à l'écoute sur le port 9814, il est possible que quelque chose d'autre ne fonctionne pas -- peut-être que le nouvel utilisateur git que vous avez ajouté n'a pas de mot de passe défini ou que la configuration SSH utilise Kerberos et que vous avez un ticket de service valide existant.

HTTP et SSH ne sont que deux des quelque six protocoles pris en charge par git. Je crois que git n'utilise jamais SSH qu'avec des URL de la forme user@host, donc je suis presque certain qu'il s'agit d'un problème d'authentification avec votre utilisateur git.

Lorsque vous clonez le repo, regardez le journal d'authentification sur votre système (typiquement /var/log/auth.log ou /var/log/secure). Si vous voyez des connexions SSH pour l'utilisateur git pendant l'opération de clonage, il est presque certain qu'il utilise SSH et non git-daemon.