En termes de recherche aléatoire, c'est Reiser qui l'emporte, suivi d'EXT4, puis de JFS. Je ne suis pas sûr que cela corresponde exactement aux recherches dans les répertoires, mais cela semble être un indicateur. Vous devrez faire vos propres tests pour cela. EXT2 bat tout le monde pour les temps de création de fichiers, probablement en raison de l'absence de journal. EXT4 bat tout le monde, sauf Reiser, que vous ne voudrez peut-être pas utiliser en raison de l'état actuel de Hans Reiser.
Vous devriez peut-être rechercher des lecteurs qui prennent en charge le NCQ et vous assurer que votre installation est configurée pour l'utiliser. En cas de recherche intensive, il devrait permettre d'augmenter la vitesse.
Enfin, assurez-vous que votre machine dispose d'une grande quantité de mémoire vive. Comme les fichiers ne sont pas souvent mis à jour, Linux finira par mettre en cache la plupart d'entre eux dans la mémoire vive s'il a de l'espace libre. Si vos habitudes d'utilisation sont correctes, cela vous permettra d'augmenter considérablement votre vitesse.