Installer aux côtés de Windows ou sur une partition séparée

Puisqu'il existe de nombreuses ressources ici sur la configuration d'un dual boot, en particulier avec un système Windows, je ne vais pas dupliquer ce contenu ici.

Cependant, il me semble que votre question reflète un malentendu qui vaut la peine d'être abordé dans une réponse.

Lorsque vous sélectionnez Installer Ubuntu* aux côtés de Windows*, l'installateur crée automatiquement une partition séparée pour Ubuntu.

Il n'est donc pas clair ce que vous avez en tête quand vous dites "installer sur une partition séparée"...

Quelle est la différence entre installer Linux aux côtés de Windows et l'installer sur une partition séparée ?

La réponse est que installer Linux aux côtés de Windows revient à l'installer dans une partition séparée.

Une partition est une section d'un périphérique de stockage qui a été formatée avec un système de fichiers particulier. Différents systèmes de fichiers ont des structures de données et des fonctionnalités différentes. Windows est généralement installé sur une partition NTFS. Ubuntu ne fonctionnera pas correctement (du moins pas sans beaucoup de bidouillages complexes) s'il est installé sur une partition NTFS ; il devrait être installé sur une partition formatée en ext2, ext3 ou ext4 ou un autre système de fichiers conçu pour fonctionner avec le noyau Linux.

Installer deux systèmes d'exploitation sur la même partition, sauf si vous en installez un dans une sorte de conteneur ou machine virtuelle (une solution populaire qui, selon votre cas d'utilisation, peut être plus pratique que la configuration d'un dual boot), est généralement une très mauvaise idée même s'ils sont compatibles avec le type de système de fichiers. Autant que je sache, dans ce scénario, les fichiers des systèmes seront mélangés, et il y a un risque que les processus écrasent des fichiers clés appartenant à l'autre système.

L'installateur Ubuntu ne tentera jamais d'installer Ubuntu dans la même partition que Windows (bien qu'il puisse formater et écraser la partition Windows) et si c'était le cas, je considérerais qu'il s'agit d'un bug sérieux.