Existe-t-il un moyen inverse de ce que fait l'option mkdir -p ?

Il y a deux façons d'y parvenir. La méthode facile est la suivante :

# Command to return only empty directories in the current directory:
find . -type d -empty -print

Maintenant, sur ma version d'Ubuntu, je peux simplement effectuer ce qui suit :

# Find empty files, and delete them:
find . -type d -empty -delete

Sinon, vous pouvez créer un script avec une logique pour compter les fichiers dans un répertoire, et les supprimer. Voici un point de départ pour compter les fichiers dans les sous-répertoires :

#!/bin/bash

for i in */ .*/ ; do 
    echo -n $i": " ; 
    (find "$i" -type f | wc -l) ; 
done

C'est plus proche de l'inverse de mkdir -p :

$ cat deldir
#!/bin/bash
[[ $# = 0 ]] && { echo "usage: ${0##*/} DIRECTORY..." >&2; exit 1; }
rc=0
while [[ $# != 0 ]] ;do
  dir=${1%/}    # in case someone specifies DIRECTORY/ out of habit
  shift
  while true ;do
    rmdir -- "$dir" || { rc=1; break; }
    [[ $dir = */* ]] || break
    dir=${dir%/*}
  done
done
exit $rc

Exemple :

mkdir -p a/b/c x/y/z
deldir   a/b/c x/y/z